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【2026年版】システム開発・アプリ開発で使える補助金3選

【2026年版】システム開発・アプリ開発で使える補助金3選

2026.09.18

【2026年版】システム開発・アプリ開発で使える補助金3選

「システム開発・アプリ開発で使える補助金」をお探しの方は多いはずです。実際、生成AIの普及で、業務システムやアプリ開発の相談は増えています。なお、2026年は補助金制度の改正が相次ぎました。そのため、本記事では2026年最新版の補助金3選をご紹介します。

具体的には3つあります。1つ目は新事業進出・ものづくり補助金です。2つ目は中小企業省力化投資補助金（一般型）です。3つ目はデジタル化・AI導入補助金（旧IT導入補助金）です。いずれも経済産業省が所管しています。そのため、システム開発・アプリ開発の費用を大きく軽減できる可能性があります。

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システム開発・アプリ開発で使える補助金一覧（2026年最新版）

システム開発やアプリ開発に使える補助金は、中小企業向けが中心です。なかでも経済産業省系の補助金は、補助上限額が大きいという特徴があります。そのため、高額なシステム開発とも相性が良いといえます。一方、自治体独自の補助金は金額が小さめです。数十万円から数百万円程度にとどまるケースが目立ちます。そのため、本記事では受給額の大きい経済産業省系の補助金3選に絞りました。

補助金名	主な活用シーン	補助上限額（特例適用時）
新事業進出・ものづくり補助金	新サービス・新システムの開発	最大7,000万円（9,000万円）
中小企業省力化投資補助金（一般型）	自社の生産性向上のためのオーダーメイドシステム開発	最大8,000万円（1億円）
デジタル化・AI導入補助金2026（旧IT導入補助金）	登録済みITツールの導入	最大450万円

※上限額は従業員規模や申請枠によって異なります。詳細はこの後の各章、および公募要領をご確認ください。

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システム開発で使える補助金①　新事業進出・ものづくり補助金

新事業進出・ものづくり補助金とは？

新事業進出・ものづくり補助金は、2026年度に誕生した新しい補助金です。なお、以前の「ものづくり補助金」と「新事業進出補助金」が統合されました。新事業進出補助金は、旧事業再構築補助金の後継です。そのため、旧制度の情報のまま申請すると、内容が古い可能性があります。この点にはご注意ください。

本補助金には3つの申請枠があります。「革新的新製品・サービス枠」「新事業進出枠」「グローバル枠」です。なかでも、システム開発・アプリ開発では、前者2枠が主な候補となります。　[新事業進出・ものづくり商業サービス補助金　公式サイト]　参照

システム開発で活用するときのポイント

しかし、業務効率化やDX化のみが目的のシステム開発は対象外となる場合があります。なお、機械装置やシステムの導入だけでは対象外です。新製品・新サービスの開発を伴わない場合も同じです。　[第1回公募要領（新事業進出・ものづくり商業サービス補助金）]　参照

一方、新サービスとしてのシステム開発は採択されやすい傾向にあります。生成AIを活用した高度な開発案件も同様です。また、新事業進出枠を使えば、新市場向けのシステム・アプリ開発にも対応できます。

補助上限額・補助率

申請枠	従業員規模	補助上限額（大幅賃上げ特例適用時）
革新的新製品・サービス枠	1〜5人	750万円（850万円）
革新的新製品・サービス枠	6〜20人	1,000万円（1,250万円）
革新的新製品・サービス枠	21〜50人	1,500万円（2,500万円）
革新的新製品・サービス枠	51人以上	2,500万円（3,500万円）
新事業進出枠	1〜20人	2,500万円（3,000万円）
新事業進出枠	21〜50人	4,000万円（5,000万円）
新事業進出枠	51〜100人	5,500万円（7,000万円）
新事業進出枠	101人以上	7,000万円（9,000万円）

補助率は、中小企業者が1/2です。小規模企業・小規模事業者は2/3です。なお、補助事業実施期間にも違いがあります。革新的新製品・サービス枠は交付決定日から10か月以内です。新事業進出枠は14か月以内です。　[第1回公募要領（新事業進出・ものづくり商業サービス補助金）]　参照

対象経費とシステム構築費のポイント

対象経費には、機械装置・システム構築費が含まれます。クラウドサービス利用費、外注費、専門家経費なども対象です。なお、専用ソフトウェア・情報システムの購入・構築費も対象です。これらもシステム構築費として計上できます。ただし、100万円以上のシステム構築費を計上する場合は注意が必要です。実績報告時に、要件定義書等の提出が求められます。　[第1回公募要領（新事業進出・ものづくり商業サービス補助金）]　参照

2026年の申請スケジュールと注意点

第1回公募は、2026年6月29日に開始されました。申請受付は2026年9月30日からです。申請締切は2026年10月30日18時までとなっています。また、採択発表は2027年1月頃を予定しています。　[第1回公募要領（新事業進出・ものづくり商業サービス補助金）]　参照

なお、2026年8月14日に公募要領が1.2版へ改訂されました。この改訂で「足下の賃上げ」が新たな審査ポイントに加わりました。そのため、採択後から交付決定までの間に、従業員への賃上げの表明が必須です。この点にも注意しましょう。　[第1回公募要領（新事業進出・ものづくり商業サービス補助金）]　参照

新事業進出・ものづくり補助金申請サポートはこちらから

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システム開発で使える補助金②　中小企業省力化投資補助金（一般型）

省力化投資補助金一般型とは？システム開発における位置づけ

中小企業省力化投資補助金一般型は、人手不足の解消を支援する補助金です。オーダーメイドの設備やシステムの導入が対象となります。そのため、生産・業務プロセスを省力化するシステム開発は有力な選択肢です。　[中小企業省力化投資補助金一般型　公募要領（第8回）]　参照

なお、2026年8月には第8回公募の公募要領が公開されました。また、第8回でも「足下の賃上げ」が新たな審査ポイントとして採用されています。　[中小企業省力化投資補助金一般型　公募要領（第8回）]　参照

対象になるシステム・ならないシステム

対象となるのは、オーダーメイド性のあるシステムです。ICTやIoT、AI、ロボット等を活用したシステムです。業務内容に応じて個別に設計・開発されたものを指します。たとえば、外部のシステムインテグレーター（SIer）と連携して構築するケースがあります。このような専用システムが該当します。　[中小企業省力化投資補助金一般型　公募要領（第8回）]　参照

ただし、対象外となるケースもあります。汎用的なパッケージソフトを単体で導入するだけの事業は対象外です。対外的に有償で提供するシステム・サービスの開発も対象外です。また、自社の人員だけで行うシステム改修の人件費も対象外です。既存システムの単純なバージョンアップ費用も同様です。この点にご注意ください。　[中小企業省力化投資補助金一般型　公募要領（第8回）]　参照

補助上限額・補助率

従業員規模	補助上限額（大幅賃上げ特例適用時）
5人以下	750万円（1,000万円）
6〜20人	1,500万円（2,000万円）
21〜50人	3,000万円（4,000万円）
51〜100人	5,000万円（6,500万円）
101人以上	8,000万円（1億円）

補助率は、中小企業が1/2です（大幅賃上げ特例適用時は2/3）。小規模企業者・小規模事業者・再生事業者は2/3です。また、補助事業実施期間は交付決定日から17か月以内です。採択発表日からは19か月以内となります。　[中小企業省力化投資補助金一般型　公募要領（第8回）]　参照

対象経費とスケジュール

対象経費は、機械装置・システム構築費（必須）です。ほかに、運搬費、技術導入費、知的財産権等関連経費も対象です。外注費、専門家経費、クラウドサービス利用費も対象です。なお、第8回公募のスケジュールは次の通りです。申請受付は2026年9月中旬に始まる予定です。締切は10月中旬の予定です。採択発表は2027年2月上旬を予定しています。いずれも予定であり、詳細は公式サイトでご確認ください。　[中小企業省力化投資補助金一般型　公式サイト]　参照

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システム開発で使えるデジタル化・AI導入補助金（旧IT導入補助金）

デジタル化・AI導入補助金とは？

IT導入補助金の名称が、2026年度から変わりました。新しい名称は「デジタル化・AI導入補助金」です。ただし、申請の仕組み自体は、これまでと変わりません。経済産業省に登録されたITベンダー経由で申請する点も同じです。そのため、スクラッチ開発には利用できません。スクラッチ開発とは、独自のシステムをゼロから開発することです。この点に注意が必要です。

対象となるITツールと補助率・補助額

対象となるのは、あらかじめ登録されたソフトウェアです。会計・受発注・在庫管理・顧客対応などの業務プロセスに対応するものが該当します。たとえば通常枠の場合、1プロセス以上の導入が対象です。この場合、5万円以上150万円未満の補助を受けられます。4プロセス以上の導入なら、150万円以上450万円以下です。　[デジタル化・AI導入補助金2026　通常枠]　参照

補助率は1/2以内が基本です。ただし、給与水準の低い従業員が多い場合は2/3以内まで上がります。また、対象経費には、ソフトウェア購入費やクラウド利用料が必須で含まれます。導入コンサルティングや保守サポートなどの役務費用も対象です。　[デジタル化・AI導入補助金2026　通常枠]　参照

デジタル化・AI導入補助金2026　公式サイトはこちら

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システム開発の補助金申請ポイント

原則として後払い（精算払い）

経済産業省系の補助金は、基本的に事業完了後の精算払いです。つまり、採択後もすぐには受け取れません。開発が完了し、完了報告を提出するまでの間は費用の立て替えが必要です。開発費用は、自己資金や借入等でまかなうことになります。

単なる効率化・DX化だけでは採択が難しい

自社の効率化やDX化のみが目的の開発は、補助対象外となるケースが増えています。革新性のないシステム開発は、認められにくい傾向にあります。そのため、業界内でも新しい取り組みだと言えるシステム開発が望ましいでしょう。革新性を打ち出せる内容にすることがポイントです。

事業の実施期限が決められている

いずれの補助金も、事業の完了期限が明確に定められています。起点となるのは、交付決定日や採択発表日です。そのため、開発が期限内に終わらない場合は注意が必要です。補助金の支給が取り消しとなるリスクもあります。

事前相談を受け付け中

システム開発・アプリ開発で補助金活用をご検討中の方は、無料相談をご活用ください。なお、事業計画の内容に応じて、最適な補助金や申請枠のご提案が可能です。

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補助金・助成金採択支援どっとコムが選ばれる理由

補助金の申請要件や審査基準は、年々複雑になっています。そのため、専門家への相談が有効です。実際に、当社にはシステム開発・アプリ開発に関するご相談が数多く寄せられています。

経済産業省系補助金の圧倒的な支援実績

特に経済産業省系補助金の支援を得意としており、支援実績は1,600社以上です。さらに、支援総額は270億円以上にのぼります。

圧倒的な採択率

ものづくり補助金でも、圧倒的な採択率を誇ります。実際に、支援数は1,000社を軽く上回り、採択率は90%以上です。

大型補助金の申請サポート

大規模成長投資補助金では、プロジェクトリーダーとして20件以上を担当しています。採択率は60%以上です。

国家資格ホルダーによる充実した支援

さらに、国家資格を持つ専門家による支援も強みです。経産省系補助金に強い中小企業診断士・行政書士等が、皆様の採択をサポートします。

【2026年版】ものづくり補助金コンサルタント、申請代行の選び方

省力化投資補助金コンサルタント、申請代行の選び方

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システム開発・アプリ開発で使える補助金　まとめ

「2026年版、システム開発・アプリ開発で使える補助金3選」はいかがでしたか。実際、補助金を活用すれば、費用負担を大きく軽減できる可能性があります。しかし、2026年は制度改正が相次いでいます。そのため、古い情報のまま申請を進めると、内容の齟齬につながりかねません。

たとえば新事業進出・ものづくり補助金と、デジタル化・AI導入補助金を比べてみます。対象となるシステム開発の範囲が異なります。手続きの方法も違います。また、いずれも審査のハードルは高いといえます。採択には、練り込まれた事業計画が欠かせません。ところが、適切なサポートを受けることで、採択の可能性は大きく高まります。補助金活用をご検討の場合は、まずは当社の無料相談をご活用ください。

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